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完成白肉灵芝基因组测序

来源 2021-11-15 20:10:19 国内新闻

  研究人员从一个单核菌株中提取了高质量的DNA,并基于Illumina和Nanopore平台组装完成第一个白肉灵芝全基因组。组装的基因组大年夜小为50.05Mb,N50为3.06Mb,猜测到78206条编码序列和13390个基因。

  白肉灵芝 吴清平团队供图

  (记者朱汉斌通信员李诚斌)近日,中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所荣誉所长吴清平团队完成了白肉灵芝的全基因组测序。据悉,这是世界上初次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相干研究揭橥于《G3:基因,基因组,遗传学》。

  白肉灵芝是在中国发明的灵芝科一新种,具有多种药理活性。作为我国具有光鲜地区特点的野生资本,白肉灵芝今朝已成为科技扶贫和带动一方经济成长的重要资本,在中国西南地区广泛栽种。但因为缺乏参考基因组,其遗传研究受到了阻碍。

  此外,研究人员分析了白肉灵芝和灵芝之间次级代谢产品(萜类化合物)的功能基因的差别。研究发明,与灵芝比拟,白肉灵芝具有更多与萜类化合物合成相干的基因,这可能是它们表示出不合生物活性的原因之一。

  据吴清平团队成员胡惠萍介绍,白肉灵芝基因组是今朝组装质量最好的灵芝属物种。该成果为往后特定物种的高原适应性深层研究奠定了基本。

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